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What is Team Challenge_from Wendell Lim

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Posted at 2012-5-1 18:02:19 | All floors |Read mode
The director of UCSF center for systems & synthetic biology kindly shared his slides about the concept of  team challenge.
See the last attachment for the full slides.







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Posted at 2012-5-2 03:44:25 | All floors
跟大家讲讲我以前参与过的team challenge(TC)吧。因为算是UCSF 学生的一堂课,所以“学习”的成分比“创造”要多一些。这次的PKU-UCSF workshop应该会更偏向于创造性和跨学科交流,就像 Wendell 在上面的pdf中提到的那些team challenge类似。

觉得这种活动是寓教于用的典范——在这种情况下学东西真的好快……人都是被逼的……

我作为组员的一个TC: 谁杀了yeast(时间:5天)
给你一试管死掉的yeast,你要找出它的死因。(以沃森和克里克爷爷的名义起誓,凶手就是……)
整个过程中,实验仪器随你用,但没有太多的提示。要命的是我们要自己做要用的基因芯片,没错,是从印芯片开始……累死累活地把实验做出来,组里有些理论基础的同学们就要开始全基因组表达量的分析,程序也得自己从头写,一时间c++ python 漫天乱飞……最后才发现,就是UCSF HAO LI LAB有个藏得很深的网站,可以直接比对你的数据和已知yeast stress response gene expression的数据。这也算是“使用任何可能的方法”来解决问题的一种感悟吧: 交流很重要。不光要没日没夜埋头苦干,也要抽点儿时间和同事去喝杯咖啡聊聊天:“哎哟我现在这问题可头疼……啥你早就做出来了……”
这些yeast都是高年级学生弄死后给我们的,最后答案揭晓的时候才发现它们的死因各种报复社会:被饿死的,被双氧水或者铜离子水齁死的,被激光照死的……
我们组找出正确答案了,houhou

我作为助教的一个TC:
给你一堆透镜,三脚架,摄像机,给我组装个显微镜儿出来。我这儿还有一堆会发光的细菌,用你组装出来的显微镜测测它发的光有啥性质。没有说明书,没有提示,没有正确答案。 为了做好助教,在活动开始前我用了两个星期自己一个人把显微镜装了一遍……
这次team challenge 成功的关键,是要调试好摄像机。而调试透镜是否在摄像机焦平面上的,我找到的最好方法是把它对着遥远的窗外,看传到电脑上的图像是否清晰。 这一点不太容易想到。整个team challenge过程中,我看着那群小孩儿们激动着讨论着向明显不靠谱的方向狂奔而去,又不能给太明显的提示,那个痛苦啊……
然后他们居然接二连三地成功了。用和我的组装方法完全不同的方式。
事实上,三个小组就创造了三种不同的装配方式。
孩子们,你们要考虑毕业了不搞科研就去尼康公司么?

我旁观的一个TC:
我们下一届的小孩儿们拿到的topic明显比寻找yeast杀手更加坑爹: 自己建微流芯片,观测细菌在其中的stress response,然后做modeling,阐释出和stress 相关基因通路的拓扑学结构。7天
具体的过程我就不清楚了,只是那一周他们做team challenge的地方灯几乎是24小时亮着的,而且最后也是几乎所有的组都出了成果,然后所有人大睡了两天——孩子们我觉得你们再用两天拾掇拾掇就可以发paper了呀……

总之吧, team challenge 就是一个你可以燃烧自己小宇宙,做出你从不知道自己可以做到的东西的神奇地方。

我还想玩一次。

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多谢版主的经验分享!  Posted at 2012-5-10 15:08
给我一块二向箔,清理用

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Posted at 2012-5-23 16:05:16 | All floors
看上去好高端的样子。。。大一的孩子表示无力了。。。

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Posted at 2012-6-2 21:26:48 | All floors
Reply zhiyuanli Add Thread


    请问:学姐,成果已什么方式呈现?会不会做很高端的实验?多少人一组?谢谢。

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主要是PPT吧,展示一下对某个问题的研究进展,提出的解决方案以及几天的研究结果等等。三四天的时间很难在实验室做出什么东西,很大程度上需要用计算机模拟。   Posted at 2012-6-3 20:55

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Posted at 2012-6-4 14:07:19 | All floors
Reply zhiyuanli Add Thread


    听起来好强悍

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Posted at 2012-6-5 13:28:53 | All floors
environment…………

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Posted at 2012-6-8 17:16:56 | All floors
学姐,有微流芯片制造技术的文献吗?感觉这个技术好强大。

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Posted at 2012-6-13 22:35:52 | All floors
能在几天的时间里做出成果好强大~
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