2021.12.06 生物大数据挖掘的新技术和新方法

2022-05-10 11:57:40

北京大学定量生物学中心

学术报告 

    : 生物大数据挖掘的新技术和新方法

报告人赵方庆 研究员

中国科学院北京生命科学研究院

    126日(周一)13:00-14:00

    生科院邓佑才报告厅 

主持人: 韩敬东 教授

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近年来测序技术、大数据技术和云计算技术的持续进步,极大促进了生物信息数据的积累,也为海量、异质、多噪的组学数据的解读带来了极大挑战。在微生物组领域,如何对缺乏参考序列的海量测序数据进行精准解析,如何深度挖掘微生物组及功能组学大数据,以及快速有效利用这些数据服务于基础研究和医学应用,这是所有微生物组学研究面临的关键难题。我们建立了一系列微生物组结构解析及功能挖掘的新技术和新方法,为微生物组大数据的深入挖掘奠定了方法学基础。在环形RNA领域,由于受计算方法及研究手段的限制,目前只发现少部分环形RNA且绝大多数功能未知。对环形RNA功能的探知,仍依赖于更多的组学数据及大量的实验验证。针对目前缺乏系统的环形RNA数据挖掘的关键技术,我们建立了环形RNA识别、转录本组装、可变剪接检测、定量和功能注释等方法。这些研究丰富了我们对环形RNA的形成机制及功能的认识,为深入解析这一崭新类型的非编码RNA分子提供了重要工具。

报告人简介:

赵方庆博士,中国科学院北京生命科学研究院研究员。2006年在中国科学院海洋研究所获博士学位,研究方向为海洋微藻的进化基因组学,在此期间获“中国科学院院长特别奖”和“国家海洋科学技术奖一等奖”。20067月至201012月在美国宾州州立大学比较基因组学和生物信息学研究中心,从事计算生物学和基因组学研究工作。先后获得中科院“百人计划”(2011)、基金委优秀青年基金(2017)、北京市杰出青年科学基金(2018)、国家杰出青年科学基金(2020)等资助。现任中科院北京生科院科研部副主任、技术平台部主任,中国生物工程学会生物信息学与计算生物学专委会副主任。在Briefings in BioinformaticsGenomics, Proteomics & BioinformaticsBMC Evolution and EcologyMedicine in Microecology Journal of Genetics and Genomics等国际学术刊物担任副主编或编委。

赵方庆研究员主要致力于建立高效的算法模型和实验技术,探索人体微生物与非编码RNA的结构组成与变化规律,以期解析它们与人类健康和疾病的关系。近年来,在CellNature BiotechnologyGutNature Communications Genome Biology 等刊物上发表通讯作者论文50余篇,其中多篇入选ESI高被引论文;先后4次荣获“中国科学院优秀导师奖”(2017, 2018, 2019, 2021)以及“中国科学院大学领雁奖章”(2020)、“中国科学院朱李月华优秀教师奖”(2020);承担的《生物信息学》先后入选“国家精品在线开放课程”(2018)和“国家级一流本科课程”(2020);培养的研究生已有人次获得“中国科学院院长奖” (包括特别奖和优秀奖)和“中国科学院优秀博士学位论文”。

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