北京大学定量生物学中心

学术报告 

题    目: 生物大数据挖掘的新技术和新方法

报告人: 赵方庆 研究员

中国科学院北京生命科学研究院

时    间: 12月6日（周一）13:00-14:00

地    点: 生科院邓佑才报告厅 

主持人: 韩敬东 教授

摘 要:

近年来测序技术、大数据技术和云计算技术的持续进步，极大促进了生物信息数据的积累，也为海量、异质、多噪的组学数据的解读带来了极大挑战。在微生物组领域，如何对缺乏参考序列的海量测序数据进行精准解析，如何深度挖掘微生物组及功能组学大数据，以及快速有效利用这些数据服务于基础研究和医学应用，这是所有微生物组学研究面临的关键难题。我们建立了一系列微生物组结构解析及功能挖掘的新技术和新方法，为微生物组大数据的深入挖掘奠定了方法学基础。在环形RNA领域，由于受计算方法及研究手段的限制，目前只发现少部分环形RNA且绝大多数功能未知。对环形RNA功能的探知，仍依赖于更多的组学数据及大量的实验验证。针对目前缺乏系统的环形RNA数据挖掘的关键技术，我们建立了环形RNA识别、转录本组装、可变剪接检测、定量和功能注释等方法。这些研究丰富了我们对环形RNA的形成机制及功能的认识，为深入解析这一崭新类型的非编码RNA分子提供了重要工具。

报告人简介：

赵方庆博士，中国科学院北京生命科学研究院研究员。2006年在中国科学院海洋研究所获博士学位，研究方向为海洋微藻的进化基因组学，在此期间获“中国科学院院长特别奖”和“国家海洋科学技术奖一等奖”。2006年7月至2010年12月在美国宾州州立大学比较基因组学和生物信息学研究中心，从事计算生物学和基因组学研究工作。先后获得中科院“百人计划”（2011）、基金委优秀青年基金（2017）、北京市杰出青年科学基金（2018）、国家杰出青年科学基金（2020）等资助。现任中科院北京生科院科研部副主任、技术平台部主任，中国生物工程学会生物信息学与计算生物学专委会副主任。在Briefings in Bioinformatics、Genomics, Proteomics & Bioinformatics、BMC Evolution and Ecology、Medicine in Microecology 和Journal of Genetics and Genomics等国际学术刊物担任副主编或编委。

赵方庆研究员主要致力于建立高效的算法模型和实验技术，探索人体微生物与非编码RNA的结构组成与变化规律，以期解析它们与人类健康和疾病的关系。近年来，在Cell、Nature Biotechnology、Gut、Nature Communications 和Genome Biology 等刊物上发表通讯作者论文50余篇，其中多篇入选ESI高被引论文；先后4次荣获“中国科学院优秀导师奖”(2017, 2018, 2019, 2021)以及“中国科学院大学领雁奖章”(2020)、“中国科学院朱李月华优秀教师奖”(2020)；承担的《生物信息学》先后入选“国家精品在线开放课程”(2018)和“国家级一流本科课程”(2020)；培养的研究生已有6 人次获得“中国科学院院长奖” (包括特别奖和优秀奖)和“中国科学院优秀博士学位论文”。