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Microbial Genomics | 李志远课题组系统揭示革兰氏阳性菌铁载体摄取的核心受体
铁是大部分细菌生长、存活和发挥致病性的必备营养元素之一。然而，自然环境中的生物可直接利用的游离铁浓度往往非常低 。为了克服这种铁稀缺的环境，细菌们演化出了一种高效的铁获取策略——向环境中分泌和铁高亲和力的“铁载体”（Siderophores）。铁载体会像猎犬一样，去四处“搜刮”环境中的铁离子。当铁载体在环境中载铁而归后，细菌细胞膜上的受体蛋白就会像“锁”一样，精准识别特定的铁载体“钥匙”，将其运输...
2026-05-08
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mBio | 李志远和杨晓静团队合作提出基于系统发育偏差的“找特长基因”新方法，挖掘细菌中的“特殊重组基...
就像北极熊有厚厚的皮毛能扛住刺骨寒冷，蝙蝠用回声定位在漆黑中自由翱翔一样，每种细菌也都有自己的“绝活”，帮助它们在独特的环境中生存。比如，有些细菌能耐辐射，有些能制造冰核来“欺负”植物，还有一种生活在海洋藻类里的细菌，特别擅长“混搭”自己的DNA，频率高到让其他细菌望尘莫及。这种“混搭”能产生化学多样性，为宿主藻类提供防御武器。但要找出这些“绝活”背后的关键基因，就像是大海捞针——细菌基...
2026-03-01
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SIDERITE Database Annual Update (2025)
Dear SIDERITE users and the siderophore research community,We are pleased to announce that the SIDERITE database (Siderophore Information Database) has completed its 2025 annual update (up to December 31, 2025).Note: If your page is not the latest version, please clear the website's cookies and refresh the page.This update marks a significant milestone:The database now contains more t...
2026-03-01
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基于基因组数据挖掘高效预测微生物铁载体互作网络
2025年1月15日，由北京大学定量生物学中心/北大-清华生命科学联合中心李志远课题组牵头，联合南京农业大学LorMe实验室和苏黎世大学定量生物医学系Rolf Kümmerli教授在国际知名学术期刊Science Advances上发表了题为“Siderophore synthetase-receptor gene coevolution reveals habitat- and pathogen-specific bacterial iron interaction networks”的研究论文。论文开发了一种经过实验验证的协同演化算法，成功从...
2025-01-15