周沛劼



电话: n/a
E-mail:  pjzhou@pku.edu.cn

实验室主页:https://cliffzhou92.github.io/
 
 



学习经历:

 

2010-2014

北京大学数学科学学院

信息与计算科学学士

2014-2019

北京大学数学科学学院

计算数学博士(导师:李铁军教授)


担任职务:

北京大学前沿交叉学科研究院研究员、助理教授、博士生导师

北京大学国际机器学习研究中心PI
北京大学定量生物学中心PI

大数据分析与应用技术国家工程实验室联聘助理教授

 

研究方向:

人工智能驱动的生命科学研究(AI for Biology)

计算系统生物学

组学大数据分析


研究兴趣:

课题组结合前沿人工智能算法和数学物理模型,发展机理-数据融合的计算系统生物学新方法,并与生物和临床医学课题组开展合作,进行生物大数据挖掘和分析。近期研究主要关注单细胞组学数据时空动态建模的理论与算法,并探索细胞多组学轨迹推断的生成式基础模型(Foundation Model)构建。


工作经历:

2019-2020

加州大学尔湾分校

数学系博士后研究员(导师:Qing Nie教授)

2020-2023

加州大学尔湾分校

数学系访问助理教授

2023.8至今

北京大学

国际机器学习中心研究员、博士生导师,定量生物学中心PI

 

代表性文章:

Peijie Zhou, Federico Bocci, Tiejun Li and Qing Nie, Spatial transition tensor of single cells, Nature Methods 21, 1053–1062 (2024)

 

Yutong Sha, Yuchi Qiu, Peijie Zhou and Qing Nie, Reconstruct Growth and Dynamic Trajectories from Single-cell Transcriptomics, Nature Machine Intelligence, volume 6, pages25–39 (2024)

 

Peijie Zhou, Shuxiong Wang, Tiejun Li and Qing Nie, Dissecting Transition Cells in Single-cell Transcriptome Data by Multi-scale Reduction of Stochastic Dynamics. Nature Communications. 12, 5609, 2021

 

Peijie Zhou, Xin Gao, Xiaoli Li, Linxi Li, Caoyuan Niu, Qi Ouyang, Huiqiang Lou Tiejun Li and Fangting Li, Stochasticity Triggers Activation of the S-phase Checkpoint Pathway in Budding Yeast. Physical Review X 11(1), 011004, 2021.

 

Federico Bocci, Peijie Zhou, and Qing Nie, spliceJAC: Identify transition driver genes and cell state specific regulatory interactions from single-cell transcriptome data, Molecular Systems Biology, 2022, 18:e11176

 

Tiejun Li, Yizhuo Wang, Guoguo Yang and Peijie Zhou, On the Mathematics of RNA Velocity II: Algorithmic Aspects, CSIAM Transactions on Applied Mathematics 5. 182-220 (2024),.

 

Tiejun Li, Jifan Shi, Yichong Wu and Peijie Zhou. On the Mathematics of RNA Velocity I: Theoretical Analysis. CSIAM Transactions on Applied Mathematics, 2(1).1-55, 2021

 

 

获奖情况:

1. 2023年国家海外高层次人才计划青年项目

2. 2019年北京大学优秀博士论文奖