北京大学定量生物学中心

学术报告 

题   目: 基于深度学习的蛋白质和RNA结构预测

报告人: 杨建益 教授

南开大学 数学科学学院

时   间: 12月21日（周一）13:00-14:00

地   点: 老化学楼东配楼101报告厅

主持人: 宋晨 研究员

摘  要:

蛋白质结构预测是计算生物学领域的一个重大挑战。近年来，深度学习的发展有效提升了蛋白质结构预测的精度。本报告中，我将先介绍我们在蛋白质结构预测中的主要工作，包括：（1）通过深度学习预测蛋白质残基间的几何信息（MapPred、trRosetta）。（2）通过约束能量最小化方法，基于Rosetta快速从头预测蛋白质结构（trRosetta）。（3）基于蛋白质残基间几何信息之别同源模板（CATHER）。最后，鉴于深度学习在蛋白质结构领域中取得的成功，我们把深度学习应用到RNA结构预测中，我将介绍这方面的初步结果（RNAsol，RNAcontact）。

报告人简介：

杨建益，南开大学教授、博士生导师。2011年博士毕业于新加坡南洋理工大学，2011-2014在美国密歇根大学从事博士后研究。2018年获得霍英东教育基金会青年教师基金。通过与Yang Zhang和David Baker等学者的合作，成功开发了I-TASSER、trRosetta和COACH等著名算法，在Nature Methods、PNAS等期刊发表SCI论文40多篇，被SCI他引4000多次。详情请见课题组网站：http://yanglab.nankai.edu.cn/ 。