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参加Biological oscillators: rhythms and synchronisation across scales会议
实验室研究生俞易同学参加在德国海德堡举办的EMBO Biological oscillators: rhythms and synchronisation across scales会议，作了题为《Delta cells modulate pancreatic islets beta-cell calcium wave originformation》的报告，介绍了通过三维胰岛钙成像系统和数据处理方法定量观察分析胰岛钙波传播的研究。该研究发现钙波起源不仅与β细胞异质性有关，还与δ细胞的空间分布相关，并通过构建局部耦合的Kuramoto模型探讨了复...
2024/04/08
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参加2023 84th American Diabetes Association 年会
实验室博士后任慧霞、谢北辰，研究生俞易参加在美国圣地亚哥举办的第84届 American Diabetes Association Annual Meetin
2024/04/08
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毕业寄语 | 前沿交叉学科研究院院长汤超院士在北京大学2023年研究生毕业典礼上的致辞
在北京大学2023年研究生毕业典礼上的致辞北京大学前沿交叉学科研究院院长中国科学院院士汤超2023年7月5日亲爱的同学们，各位老师，各位来宾：大家好！很高兴能在今天这个重要的日子，作为教师代表，在这里与你们分享。我想以“和而不同”为主题，谈谈我的一些想法。“君子和而不同”出自《论语》，意思是君子追求与人和谐而不是相同。一个人应该保持自己独立的人格、独立的思考，同时尊重他人。只有这样，才能达到真正意义上的...
2023/07/14
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随机梯度下降如何帮助深度学习找到泛化能力强的解
2023年6月7日，北京大学定量生物学中心、物理学院、生命科学联合中心汤超课题组和美国IBM沃森研究中心的涂豫海教授合作，在《Physical Review Letters》杂志上在线发表题为“Stochastic Gradient Descent Introduces an Effective Landscape-Dependent Regularization Favoring Flat Solutions”的研究论文
2023/06/10
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参加2023年APS March Meeting
2023年3月22日，汤超实验室两位研究生参加了在拉斯维加斯举办的美国物理学会（APS）2023年三月会议，会议时间为3月5日至3月10日。杨宁同学在3月7日上午作了题为《Stochastic gradient descent introduces an effective landscape-dependent regularization favoring flat solutions》的报告，从统计物理的角度解释了随机梯度下降（SGD）算法如何在过参数化神经网络中的损失函数景观上帮助寻找到更平坦也即泛化能力更强的解。有...
2023/03/22
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PLoS Comput. Biol. - 构建线虫胚胎早期发育形态的可计算模型
点击这里阅读我们的新闻 :)点击这里探索更多本文信息尽管自然环境中卵或胚胎的大小总存在涨落，发育过程却总能使组织、器官、和身体结构保持正确的比例。这种性质被称为尺度不变性。尺度不变性在诸多发育和再生体系中均存在，近百年前便引起了研究者的关注。在一些例子中，尺度不变性可以由一个能随胚胎或器官尺寸而等比例变化的形态发生素浓度梯度而产生，比如果蝇的翅成虫盘。下游基因表达只要忠实地读取形态发生素的浓度阈值...
2022/07/07
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“胰岛细胞的集体探戈舞”--集体锁相的胰岛alpha与beta细胞
胰岛是机体最重要的血糖调控微器官。在高糖刺激下，胰岛细胞呈现周期性钙震荡-根据周期分为快速，慢速，及复合震荡模式。胰岛震荡信号的消失与糖尿病进程高度相关，因而其调控机制一直被广泛研究。本研究首先结合微流控芯片与钙离子荧光显微镜成像，发现在同一胰岛中，空间上细胞激活顺序高度保守，时间上震荡周期高度可重复-说明震荡模式是胰岛稳定的内在性质。进一步我们构建了 alpha与beta细胞双色钙荧光蛋白标记转基因小鼠...
2022/07/07
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果蝇胚胎如何保证它的身体比例
点击这里阅读我们的新闻 :)点击这里探索更多本文信息尽管自然环境中卵或胚胎的大小总存在涨落，发育过程却总能使组织、器官、和身体结构保持正确的比例。这种性质被称为尺度不变性。尺度不变性在诸多发育和再生体系中...
2022/07/07
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PLoS Comput. Biol. - 构建线虫胚胎早期发育形态的可计算模型
细胞是生命的最小活动单位。不同物种、器官、组织的细胞具有不同的形态，而形态表征了细胞的力学属性和功能。什么样的数学物理方程能够准确描述细胞形态的动力学特征，对于生物力学、细胞生物学和发育生物学都是一个...
2022/01/21 admin
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Phys. Rev. E - 线虫胚胎细胞谱系优化原理
2021年11月23日，北京大学汤超实验室、香港浸会大学汤雷翰实验室在《物理评论E》（Physical Review E）发表文章Volume segregation programming in a nematode's early embryogenesis，提出秀丽隐杆线虫胚胎通过精准...
2021/12/10 admin
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实验室博士后刘奇在国际会议“定量生物学2021：衰老与更新“介绍关于衰老的研究”
2021年7月15日，实验室博士后刘奇在国际会议“定量生物学2021：衰老与更新“上报道了他的最新研究进展。在口头报告中，他介绍了如何通过改变细胞生境来让衰老的静息态裂殖酵母细胞获得新生。他同时还在海报环节展示了...
2021/11/29 admin
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57th EASD 2021 meeting
2021年美国糖尿病协会第57届欧洲糖尿病研究协会年会（EASD）于9月27日到10月1日线上召开。大会以演讲、专题会、口头报告等形式展示了糖尿病领域的研究进展欧洲糖尿病会议。实验室的博士后任惠霞在Keeping the balanc...
2021/11/28 admin
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集体锁相的胰岛alpha与beta细胞
胰岛是机体最重要的血糖调控微器官。在高糖刺激下，胰岛细胞呈现周期性钙震荡-根据周期分为快速，慢速，及复合震荡模式。胰岛震荡信号的消失与糖尿病进程高度相关，因而其调控机制一直被广泛研究。 本研究首先结...
2021/11/28 admin
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“万能“的细胞分割软件--Cellbow
光学显微镜目前被广泛的用来定量研究单细胞特性，量化的精度依赖于细胞分割的精度。迄今为止，细胞分割仍然是图像处理领域挑战性十足的问题。由于成像参数、生物组织差异等因素导致不同实验室细胞边界特征分布差异性...
2021/11/28 admin
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恭喜沈靖翔同学顺利通过博士毕业答辩
沈靖翔同学于2021年6月3日参与博士毕业答辩，报告题目为果蝇体节发育的尺度不变性，参与答辩老师包括北京大学的欧阳颀、陶乐天、张磊、杨晓静和汤超老师，以及两位校外专家雷锦志和马骏老师。 &nbs...
2021/07/19 admin
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五四青年节实验室聚餐
去年，由于突如其来的疫情，20届毕业生未能参与学位授予仪式，留下遗憾。今年5月4日，正值五四青年节与北大校庆，学校特意补办仪式并邀请校友回家。TangLab往届的师兄师姐也参与其中，回到实验室和大家一起庆祝这重要...
2021/05/08 admin
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参加温州重大项目启动会暨生物医学物理中心青年论坛
Tanglab成员于2021年3月31日至4月2日前往温州参加“生命系统中非平衡统计物理和动力学的若干重大问题”重大项目启动会暨生物医学物理中心青年论坛，实验室杨晓静老师，博士后任惠霞，博士生沈靖翔、关国业做了会议报...
2021/04/10 admin
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2020冬季青龙峡团建
2020年12月6日中午，tanglab的成员们一起从北京大学出发，向怀柔青龙峡脚下的一处“醉懒别墅”出发，进行为期两天的团建活动。 从北京大学出发，将近2小时的车程中，游戏是必不可少的环节。杨晓静老师为我们特意...
2020/12/19 admin
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汤超实验室与合作者构建线虫胚胎发育形态学图谱并发表于《自然·通讯》
2020年12月7日，北京大学汤超实验室、香港浸会大学赵中应实验室、香港城市大学严洪实验室在《自然·通讯》（Nature Communications）在线发表文章Establishment of a morphological atlas of the Caenorhabditis...
2020/12/08 admin
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汤超教授被《神州学人》报道
汤超教授被《神州学人》杂志以封面人物进行了专题报道。汤超教授致力于用物理学思想及方法研究生物问题，希望能以国际领先水平为国家的发展出力。详情见2012年第12期《神州学人》的《用物理来发现新的世界》。
2020/07/24 admin
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线虫胚胎细胞谱系的优化原理
秀丽隐杆线虫模式化的细胞谱系已经被发现近40年，其细胞以特定的分裂比例和分裂时间进行增殖，在时间上形成固定的顺序。然而，该特定谱系模式背后的优化原理一直未知。本文基于两点假设对线虫细胞谱系进行随机模拟：...
2020/07/17 admin
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恭喜田冰珲、任惠霞、黎彦君顺利博士毕业！
在这意义特殊的毕业季，汤超实验室三位同学田冰珲、任惠霞、黎彦君顺利完成博士毕业答辩，获得北京大学博士学位，恭喜各位，祝大家前程似锦！田冰珲博士的研究构建了线虫早期胚胎发育的力学模型，从力学视角看秀丽隐...
2020/07/02 admin
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参加第八届生物信息学与计算生物学国际会议
由电气与电子工程师协会（IEEE）和生物与生物信息学学会（BBS）主办的2020年第八届生物信息学与计算生物学国际会议于2020年5月16⽇⾄18⽇线上召开。实验室博士研究生关国业同学参与了本次大会，介绍课题“Investigat...
2020/06/24 admin
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肌肉特异转录因子hlh-1在秀丽隐杆线虫胚胎的分层调控网络
线虫胚胎在单细胞尺度控制着组织的命运分化和空间排布；虽然许多细胞的发育行为能够被追踪观察，其背后精细的调控因素仍有待研究。本文以体壁肌肉分化的启动基因hlh-1为研究对象，该组织主要由MS、C、 D谱系产生...
2020/06/24 admin
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汤超实验室在Cell Reports发文揭示细胞周期抑制因子Whi5的分子机制
2019年10月22日，北京大学汤超教授、杨晓静助理研究员团队（共同一作为屈弋淼、蒋俊和刘祥博士）在Cell Reports杂志上发表文章Cell Cycle Inhibitor Whi5 Records Environmental Information to Coordinate Growth a...
2020/06/15 admin
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汤超实验室和Raul Andino实验室合作在bioRxiv上发文研究突变的动力学模式的数学模型
进化的一个核心问题在于如何定量理解生物种群中突变积累的过程。然而，受限于传统技术的测序精度，之前研究主要集中于高丰度的突变。合作实验室、加州大学旧金山分校Raul Andino课题组使用所开发的CirSeq技术，测量了...
2020/05/10 admin
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汤超与刘莉实验室合作在Scientific Reports和Communications Biology杂志上发文研究iPS细胞诱导的心肌细...
2020年2月19日和3月13日，北京大学汤超教授以及大阪大学刘莉教授团队（共同一作为李俊君和张璐博士）在Scientific Reports和Communications Biology杂志上发表文章Analysis of circulating Waves in tissue Rings&nb...
2020/05/08 admin
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汤超实验室在Physical Biology上发文研究线虫胚胎发育中分裂方向和顺序的鲁棒性
在胚胎发育过程中，受精卵如何通过细胞的分裂分化实现复杂的多细胞时空分布，以构建具有完整功能性状的个体，是科学家们关心的问题。在这一领域中，Sulston等人发现秀丽隐杆线虫的胚胎发育具有非常独特的发育模式，即...
2020/05/08 admin
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2020年Aspen冬季会议
2020年1月5日至10日，汤超教授和实验室成员刘祥、夏康和杨宁参加了Aspen冬季会议，会议主题为“New physcial model for cell growth”，来自美国、欧洲等地的几十名学者讨论细胞生长的实验工作和理论进展。汤超教授作...
2020/05/08 admin
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2019年定量生物学年会
2020年1月14日，北京大学定量生物学中心2019年度学术年会在金光生命科学大楼邓佑才报告厅召开。汤超教授代表中心致欢迎辞，中心副主任来鲁华教授对中心过去一年工作进行了回顾与总结，主要包括团队建设、科研进展、国...
2020/05/08 admin
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Chris Sander教授来实验室访问
2019年9月30日，来自哈佛医学院的Chris Sander教授来实验室访问，并与同学们共进午餐，Sander教授亲切地分享了在蛋白质折叠领域及癌症早期预测等重要生物问题的工作与想法，令同学们受益良多。
2020/04/01 admin
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揭秘细菌挑食之谜
给你一个冰淇淋和一块蛋糕，你先吃哪个？一块面包和一个牛油果呢？两个一块吃吗？1941年微生物学家Jacques Monod给细菌提出了同样的问题。他给大肠杆菌同时提供两种食物（碳源），结果看到了两类不同的现象：对某一些...
2020/03/31 admin
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参加国际自然-代谢会议
Nature conference on cellular metabolism 会议于4月8-11号在美丽的厦门召开。实验室博士生夏康，李乐参加了此次大会。夏康进行墙报展示，分享“解密细菌挑食之旅”的成果。
2020/03/31 admin
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欢迎李志远博士回家
2019年5月10日，我们的大师姐李志远博士再次回到北京大学，带来题目为“From fitness landscapes to seascapes: competition, cooperation, and diversity of microbes”的报告。并回到我们实验室跟师弟师妹们分享科...
2020/03/31 admin
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参加定量生物学2019国际会议
定量生物学2019国际会议于6月22-24在美丽的滨海城市烟台召开。今年主题为“Dynamic signaling in cells and embryos” 实验室多位同学进行海报展示，博士生秦山山，洪佳音，徐小婵获得杰出海报奖。沈靖翔做口头报告介...
2020/03/31 admin
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恭喜刘祥、张璐、尹佩佩、洪佳音、李昊洁顺利通过博士毕业答辩！
恭喜实验室成员刘祥、张璐、尹佩佩、洪佳音、李昊洁5人于2019年11月28日顺利通过博士毕业答辩，获得博士学位！
2020/03/31 admin
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参加第22届秀丽隐杆线虫大会
第22届国际秀丽隐杆线虫大会于2019年6月20⽇⾄24⽇在美国洛杉矶召开，此次⼤会吸引了来自全球超过一千五百名从事线虫研究的老师和学生，与会者充分展示了发育、神经等领域的最新研究进展。实验室博士研究生关国业同学...
2019/06/24 admin
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APS March Meeting 2019
美国物理学会2019年三月会议于三月4⽇⾄8⽇在波士顿召开，此次⼤会吸引来自全球超过⼀万⼀千名的物理学家和学⽣参与。在为期一周的会议中，与会者充分展示了各自研究领域的进展。实验室的秦山山和李倩怡同学参与了本...
2019/03/08 admin
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2019年Q-Bio冬季会议
2019年2月18日至22日，第7届Q-Bio冬季会议在夏威夷瓦胡岛召开。会议内容涵盖定量与系统生物学的各个方向。杨晓静老师和实验室研究生屈弋淼、李昊洁、张明悦、刘祥、张璐、黎彦君、任惠霞、夏康参与了此次会议，并张贴...
2019/02/22 admin
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2018定量生物学中心年会
2019年01月11-12日，定量生物学中心在北京宽沟举办年会，本次会议包括特邀报告，墙报展示，研究生报告等方式促进不同实验室之间交流合作。实验室博士研究生沈靖翔在会议上作报告。我们的大师兄秦山山获得定量生物学中...
2019/01/12 admin
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欢迎 Alexander和史文佳博士来实验室访问
2019年01月初，来自波尔研究所的博士研究生Alexander，来实验室进行为期三个月的访问。西安理工大学的史文佳博士来课题组访问两星期，并在组会上介绍了她目前进行的研究。史文佳师姐2016年从实验室毕业，这次回实验室...
2019/01/06 admin
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参加CBIS会议
2018年12月21-25日，华人生物学家协会（Chinese Biological Investigators Society） 第十二届会议在深圳召开，CBIS每两年举行一次会议，此次是第十二届，年会宗旨是与海内外生命科学领域的科研人员交流科研最新进展...
2018/12/25 admin
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参加2018冷泉港亚洲会议
2018年11月5-9日，2018冷泉港亚洲“单细胞基因组学前沿”会议在苏州召开，实验室博士后朱少奇，博士研究生徐小婵、盛南参加此次会议。本次会议邀请了来自全球各地的单细胞乡姑纳领域的杰出学者做报告，内容涉及单细胞...
2018/11/09 admin
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参加2018世界生命科学大会
2018年10月27-29日，世界生命科学大会在北京国家会议中心召开，本次大会邀请5位诺贝尔得主作报告，设置60个专题论坛。会议邀请生命科学领域400余名世界顶尖的科学家做报告。实验室博士研究生秦山山，李乐，盛南，徐小...
2018/10/29 admin
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索邦大学暑期学校
2018年7月1日至7月28日，实验室博士研究生李乐，黎彦君，任惠霞，本科生施博文，姜嘉隆参加了法国巴黎索邦大学举办的“北京大学-索邦大学暑期夏令营”，期间他们分别参观索邦大学及巴黎高师9个生物及定量生物研究实验...
2018/07/28 admin
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李志远博士访问汤超实验室
2018年7月15-18日，李志远博士访问了定量生物中心及汤超教授实验室，她于2014年获得加州大学旧金山分校生物物理专业获得博士学位，现为普林斯顿大学理论科学中心博士后。访问期间，她在中心给了题为“A unification ...
2018/07/18 admin
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北京大学定量生物学中心2018年度国际会议-神经科学与人工智能会议
2018年7月2日至6日，北京大学定量生物学中心2018年度国际会议--“神经科学与人工智能”顺利举办。本次会议共邀请了24位来自美国、英国、法国、以色列等海内外神经科学和人工智能领域的顶尖专家和学者，来自全国和世界...
2018/07/06 admin
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恭喜高总茂获得博士学位
实验室博士研究生高总茂于2018年7月通过博士答辩获得北京大学博士学位。其在博士期间的主要工作是通过光遗传方法扰动CDK，系统性的研究了细胞周期中各事件发生顺序的稳健性，同时对蛋白质在细胞分裂谱系中的遗传性质...
2018/07/01 admin
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华泰立教授访问汤超实验室
来自加州大学圣迭戈分校的华泰立教授于2018年6月20日至26日访问了定量生物学中心和汤超教授实验室。访问期间，他在定量生物学中心做了一场题为“Strategies of growth control: how simplicity emerge from biomolec...
2018/06/26 admin
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实验室徐小婵同学参加ISSCR会议
2018年6月20号至6月23号，国际干细胞协会年会（The International Society for Stem Cell Research Annual Meeting）在澳大利亚墨尔本隆重举行，本次ISSCR会议邀请了来自全球的干细胞相关领域的杰出科学家做报告，报...
2018/06/23 admin
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Don Kulasiri 教授访问汤超实验室
来自新西兰林肯大学的Don Kulasiri 教授于2018年4月9日至4月23日访问汤超教授实验室。访问期间，他在定量生物学中心作了一场题为“Modelling of Synaptic Plasticity and Inherent Stochasticity”的学术报告，与中心...
2018/04/23 admin
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第二届北京大学前沿交叉学科研究生论坛
2018年4月20日，实验室师生参加了第二届北京大学前沿交叉学科研究生论坛，此次会议邀请了12位来自生物、医学、纳米、大数据等不同交叉学科的国内外知名专家学者在论坛作了专题报告，并设置“生物与医学前沿交叉”“大...
2018/04/20 admin
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Erik Gylfe 和 Anders Tengholm 教授访问汤超实验室
来自瑞典乌普萨拉大学的Erik Gylfe教授和Anders Tengholm教授于2018年4月9日至 4月13日访问了定量生物学中心和汤超教授实验室。访问期间，他们做了两场专题报告，介绍了其实验室几十年来四代科学家对胰岛细胞震荡活动...
2018/04/13 admin
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何柏毅访问汤超实验室
来自美国哈佛大学Ariel Amir教授组里的博士研究生何柏毅于2018年4月10日到12日访问了汤超教授实验室。访问期间，他介绍了他关于细菌细胞周期方面的工作，并与大家进行了科学研究及科研生活的诸多交流。
2018/04/12 admin